Docking@Home

http://distributed.ru/wiki/pro:docking

Docking@Home

Docking at Home — cовместный некоммерческий BOINC-проект распределенных вычислений Университета Делавэра, Научно-исследовательского института Скриппса и Университета Калифорнии в Беркли, поддерживаемый Национальным научным фондом США.

docking.jpgВ проекте происходит предварительный отбор веществ, которые могут стать основой новых или улучшения существующих лекарственных препаратов. Для этого компьютеры участников просчитывают химические свойства комплексов лиганд-белок (малая молекула-рецептор) — этот процесс называется молекулярным докингом (конструированием лекарств). Если быть более точным, то в проекте Docking@Home производится «гибкий докинг» (flexible docking), когда учитывается конформационная подвижность лиганда, а модель белка-рецептора считается статичной. Или говоря человеческим языком, на неизменной модели белка (в рамках текущего эксперимента) тестируются различные варианты лигандов (малых молекул). Расчеты выполняются с помощью модуля CHARMM (Chemistry at Harvard Macromolecular Mechanics), это одна из самых точных вычислительных программ для молекулярного докинга.

Среди главных задач проекта Docking@Home числится поиск малых молекул, подавляющих развитие в организме вируса иммунодефицита человека (ВИЧ). Информация о наиболее перспективных малых молекулах, найденных с помощью проекта, публикуется в открытых источниках и не защищена авторскими свидетельствами. Таким образом, результатами проекта может воспользоваться каждый, кто пожелает это сделать.

Подключение к проекту Docking@Home

Вы тоже можете присоединиться к Docking@Home. Для этого скачайте последнюю версию BOINC-менеджера — это универсальная программа для участия в распределенных вычислениях. Установите BOINC: инструкцию как это сделать вы найдете в этом разделе. Запустите BOINC и войдите в режим Advanced View. Найдите в меню «Сервис» пункт «Добавить проект». В появившемся окне «Выбор проекта» отыщите Docking@Home в перечне проектов или скопируйте в поле «Адрес (URL)» следующую ссылку:http://docking.cis.udel.edu/ После этого BOINC предложит вам создать учетную запись — введите адрес своего работающего электронного ящика и пароль. Пойдет загрузка файлов проекта, а по ее завершении начнутся вычисления. Поздравляем с присоединением к проекту Docking@Home!

Не забудьте посетить и настроить свою учетную запись, это можно сделать с любого места на официальном сайте проекта, введя свою электронную почту и пароль в форму в верхнем правом углу. Если у вас возникнут вопросы, зарегистрируйтесь на нашем форуме и задайте их.

Ссылки


pro/docking.txt · Последние изменения: 2009-05-06 15:08 RM
Comments